Bergen Havn er sammen med Oslo og Tromsø havner utpekt som beredskapshavn etter IHR- forskriften Dette er havner som skal ivareta særskilte oppgaver, slik at de kan håndtere en alvorlig hendelse som kan ha betydning for internasjonal folkehelse, slik som covid-19.

Det betyr at disse havnene kan i beredskapssammenheng benyttes som mottak når det foreligger en alvorlig hendelse. Dersom situasjonen er av en slik karakter at det anses som påkrevd; for eksempel omfattende smitte med covid-19, svært små havneforhold med lite ressurser eller stor belastning i den konkrete situasjonen, gir IHR-forskriften adgang til at skipet kan henvises til nærmeste utpekte havn.

IHR-forskriften åpner for at helsemyndighetene kan iverksette tiltak mot personer inkludert karantene av fartøy. Det er samtidig presisert i forskriften at skip ikke av folkehelsehensyn kan nektes å anløpe eller ankomme en havn, losse eller laste last eller forråd, og skal tillates å ta om bord drivstoff, vann, mat og forsyninger (§ 17).

Det er helsemyndighetene, ikke havnen,  som regulerer om personer får gå i land eller ikke, i henhold til smittevernloven.

Helsedirektoratet utpeker hvilke havner, lufthavner og grensepasseringssteder som skal ivareta særskilte oppgaver, slik at de kan håndtere en alvorlig hendelse som kan ha betydning for internasjonal folkehelse.

Kommunen skal sørge for at utpekte havner har tilgang til de lokaler og det personale og utstyr som er nødvendig for kontroll av passasjerer, bagasje, last, containere, transportmidler, humant biologisk materiale, postsendinger og varer, herunder dyr og planter, for å beskytte mot en alvorlig hendelse som kan ha betydning for internasjonal folkehelse.